Um ex-membro de um clã ninja desistiu para viver uma vida tranquila com sua esposa e filho. Uma noite, sua família morre após ser atacada por uma organização misteriosa. O homem é torturado pelas consequências.

Following the incident in the Southeast Asia Union in 2116, Shinya Kogami resumes his vagrant journey. In a small South Asian nation, Kogami rescues a bus of refugees under attack by armed guerrilla forces. Among the refugees is a young lady by the name of Tenzin, who begs Kogami to teach her how to retaliate against the enemy.

Kai se muda com seu pai de Tóquio para Hinashi, uma cidade pesqueira em declinio, para viver com seu avô após o divórcio de seus pais. Kai é incapaz expressar seus complexos sentimentos sobre seus pais, assim ele passa sua vida escolar no ensino médio de forma melancólica. Sua única alegria é fazer o upload de suas composições musicais para a internet. Um dia, seus colegas Kunio e Yuuho convidá-o para se juntar à sua banda, e quando ele relutantemente os acompanha para praticar na Ilha da Sereia, os três encontram uma sereia chamada Lu. Através de seu alegre canto e dança, Kai lentamente é capaz de se abrir sobre seus sentimentos. No entanto, uma calamidade chega e Kai deve gritar do fundo do seu coração, para salvar a cidade.

Momentos antes do nascimento de Naruto Uzumaki, um enorme demônio conhecido como o Kyuubi, a Raposa de Nove Caudas, atacou o vilarejo da folha oculta Konoha, causando destruição. Para pôr fim à devastação de Kyuubi, o líder da aldeia, o quarto Hokage, sacrificou sua vida e selou o monstruoso animal dentro do recém-nascido Naruto. Agora, Naruto é um ninja hiperativo e cabeça dura que ainda vivem em Konoha. Evitado pelos demais habitantes por causa da Kyuubi dentro dele, Naruto se esforça para encontrar seu lugar na aldeia, enquanto o seu ardente desejo de se tornar o Hokage de Konoha o leva a conhecer alguns grandes novos amigos, e também alguns inimigos mortais.